软件保护世界上最濒危的物种

通过结合遗传和环境数据库，EPFL的研究人员正在寻求帮助生物学家更准确地识别最易受气候变化影响的动植物物种，以便开发适当的保护方法。

摩洛哥北部是一种具有特定基因的绵羊的家园，它发展了数千年的进化。该基因使绵羊从其外壳中分泌出一种蜡，保护它免受其生活的高阿特拉斯地区的强降水的影响。通过防止绵羊皮大衣腐烂，该基因可以保护它免受潜在致命的皮肤病。

在EPFL，地理信息系统实验室(LASIG)的研究人员开发了软件来协助进化生物学家。通过为他们提供同时和直接访问具有自动基因组注释和气候数据库的生物信息学数据库，它可以节省数周的工作量。气候数据库包含特定地区的降水，风，阳光和云层覆盖的信息。该软件名为R.Samada，评估遗传和环境信息之间的关系，并生成图表和地图，使研究人员能够快速可视化数据。该软件在Molecular Ecology Resources发表的一篇论文中公布。

当他们生成一张摩洛哥地图，显示绵羊的位置，其特征是保护它们免受雨淋的遗传标记，生物学家将会看到该基因的某种变体仅存在于生活在阿特拉斯地区山区的绵羊中。在摩洛哥南部的沙漠中，绵羊缺乏这种遗传标记。根据政府间气候变化专门委员会(IPCC)的数据，气温上升3.7°C的2070年的气候情景显示该地区的降水量将减少，因此许多绵羊很可能需要另一种基因变种适应即将到来的干旱。

“该软件识别物种进化过程中所涉及的基因，以适应天气条件”，该论文的第一作者Solange Duruz的论文的相应作者StéphaneJoost解释道。“通过这个软件，我们希望为进化和保护生物学家提供一个单一，简化的途径，以获取通常用于评估物种状况的遗传和地球环境信息的所有处理和分析，特别是那些生存受到威胁的物种。气候变化。“

做出正确的决定

随着气候变化，摩洛哥绵羊会发生什么?如果他们居住的降雨量较少怎么办?随着地球变得更加温暖，随着生物多样性的减少，进化生物学家正在追求两个平行的目标：他们希望冷冻保护濒临灭绝的物种的DNA，并确定物种在特定气候情景中最有可能存活的环境。由EPFL开发的软件将通过展示遗传变异与某些生态气候区域的匹配程度来帮助他们做出正确的决策。

R.Sambada是一个系统的最新版本，已经在EPFL开发了十多年。它是市场上可用的五种类似软件包之一，显示出不同程度的复杂性。R.Samada目前是其中最快的。“我们鼓励研究人员将我们软件的结果与其他系统的结果进行比较，以使他们的分析和方法更加稳健，”Joost补充说。

通过目前正在进行的博士研究。论文，EPFL打算进一步开发其软件，其目的是根据各种气候情景生成保护区，从现在到2100年，温度增加在1.5°C到4°C之间。“一旦软件具有此功能，我们将能够更准确地确定危险区域和那些可以提供避难的区域，“Joost总结道。还计划开展工作，使该系统适应海洋区域，以保护珊瑚，并提高地图分辨率。