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哈佛医学院的一名研究员利用深度学习仅根据氨基酸序列预测任何给定蛋白质的结构。
根据4月17日在线发表在《细胞系统》杂志上的一项研究,这项在公共领域使用开源软件取得的进步具有改变生物医学研究的几乎所有方面的潜力。
在哈佛大学新闻部的报道中,研究人员穆罕默德·阿尔库莱希(Mohammed AlQuraishi)博士说,蛋白质折叠是蛋白质化学家(在该过程中,蛋白质结构呈现其功能性形状的过程),在过去的半个世纪中,它一直是生物学家。
本质上,所有生物过程都是由蛋白质执行或受蛋白质影响的,因此了解和预测其折叠方式可以为各种疾病和健康问题的临床研究提供参考。
AlQuraishi说:“我们现在有了一个全新的前景,可以用来探索蛋白质折叠,而且我认为我们才刚刚开始涉足这一领域。”
他的工作可能会挑战Google AlphaFold背后的科学家的工作,后者使用AI来预测蛋白质折叠,而不是通过分析其氨基酸序列,而是通过组合大量的基因组数据来预测。
AlQuraishi的学术导师Peter Sorger博士就成就的这一方面发表了评论。
索尔格说,这非常了不起,一个从事开源软件工作的研究员可以在计算机科学最热门的领域之一与Google之类的公司竞争。
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